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『この閉じた場所ではなく、世界の全てに行きたい』500年ほど過去、地球に5つの隕石が近づき、五大流星雨（5thスターレイン）と呼ばれる大災害が発生し、辛い冬の時代が訪れた。人類は地下や海底、または地表に造られたアーコロジーと呼ばれる建造物へと移住し、地球の環境が再生する日を待ち続けていた。――外は人の住めぬ不毛の地。平和な箱庭であるアーコロジーに住む人々は、外への興味を失っていき、いつか帰る場所という意識を徐々に無くしその自分の住む世界のみを見るようになっていった。舞台はアーコロジー『アクアリウス』かつて国際中立研究機関として建造された人工島は、人々を収容するアーコロジーとして姿を変え、そして500年の年月を経て全く違う形へと変貌していた。中央と外周。富を持つ者と貧しい者。多くの意味で二極化した社会がそこにはあった。そこに住む青年、竜胆蒼司は貧しい者の住む外周区で生まれ育った孤児であった。彼はその孤児院で恩師である青色をした女性と出会った。彼女は博識で蒼司に多くの事を教えてくれたが、しかし彼女は蒼司とその姉を救い姿を消してしまった。その女性を救えなかった蒼司は、それから力を求めるようになる。弱い子供の自分が許せず、この街で通用する力を。力を求め続ける蒼司は、それが正しいと信じて居た。そんな蒼司の前に、消えてしまった彼女にそっくりの少女が現れる。――アズライト。10年近く前に消えたままの姿、そして同じ名前の少女が。貴族と犯罪結社、中央と外周、過去と現在。二重構造の箱庭の中で力を求める少年に訪れた出会い。この日を境に、歪みを抱えたアクアリウスは終わりを始めていく――。特集： 特集：

「――進退窮まった」倉上進矢は追い詰められていた。事故により長期の入院生活が開けた後、彼の立場は一変していた。諦めて働こうとした所に、初めて訪れた幸運。懐かしい幼馴染からの連絡と再会。彼女がもたらしたのは、新しい学園と月光館という古ぼけた洋館だった。懐かしい街で、進矢は少女達と出会う。絶対無敵の幼馴染「神凪莉都」事故の原因のクラスメート「今里和奏」負けず劣らず不幸な下級生「東条白雪」莉都と犬猿の仲の生徒会長「名凪星華」月光館を預かるメイドさん「夕月小夜璃」新天地での新しい生活。暖かい人たちと、新しい家。ここでイチから頑張ろう。そう決意した彼に、ある夜、一人の少女が告げる。――おぬし、今のままだと10日ほどで死ぬぞ。幸御魂《タマ》という少女との出会い。彼女の力で幸運を与えられピンチを助けられるが、ますます窮地に立たされる事になる。幸運を前借りした負債は3つ。一つ、進矢たち本人の運がなくなる一つ、他人の不運を肩代わりする一つ、返済しきれない場合「不幸」となって訪れるこの日から、進矢達には様々な事件、事故が降りかかる。学園で起こった窃盗や誘拐事件。女子寮の不審者。ストーカー、盗難事件。街にも学園にも、不幸の種は眠っている。人々の抱える不幸を解決し、少しずつ幸運を集めて窮地を救え！明るい未来を掴むため、仲間達と東奔西走する事になる。

「彼女はちょっと変わっていて、誰よりも真っ白い心をもっていた――」少し前は田舎で、今は急速に発展した科学研究が盛んな街――長浜研究学園都市。5年前に家族を事故で亡くした大学生、椋木悠斗はこの街で母親と二人暮しをしていた。幼馴染の真央や、後輩の心音。街の何でも屋の式澤と助手の笹原。 そしてお世話になってるバイト先の店長さん――。科学で溢れた街は都会とは違う空気を持ち、どこかせわしなくも暖かい。そんな変わらない日々に、一人の少女が訪れた。どこまでも無垢な白い少女。ユキ。死んだ父親に関係があるらしい少女との出会い。そうして悠斗は、幾つかの事件に遭遇し過去の真実を知ることになる――。