世界的な食糧危機の中、日本はC国によって、武力征服される。征服者達は若く美しい女達を狩り集め、凌辱の末に食糧として屠殺する。ここまでが前作『イエロー・ムーン 前編』のあらすじです。本作品は、征服後の東京を主な舞台とし、さらに日本政府と自衛隊の生き残りが、植民地転覆を賭けて、C国政府に戦いを挑むというストーリーになっております。全編に猟奇的で官能的なカニバリズムシーンが登場します。