人と妖怪の繋がりが希薄になって久しい現代。古びたバスに揺られ、退魔巫女・新堂勇（しんどういさみ）はこの物語の主人公・石動大（いするぎまさる）と共に岳杜神社を訪れた。迎えてくれた岳杜神社の巫女・八代護（やしろまもり）と祈（いのり）の姉妹によると、最近妖怪によるものと思われる事件が頻発しているらしい。彼女たちはその調査のために派遣されたのだが、そこへ近くの古城を根城とする鬼三兄妹の末妹・向日葵（ひまわり）が現れ、石動を親殺しの罪で糾弾し始めるのだった。