全国からニホンの未来を担う人材が集まる名門『大江戸学園』。古めかしい江戸風の町並みと現代技術が混じり合う学園島を、刀を提げた学生たちが闊歩する。転校してきたばかりの主人公・秋月八雲（あきづきやくも）にとって、学園生活は驚きに満ちたものだった。自立心向上のために生活費は学生自身が商売で稼がないといけないのが学園のルール。学業のかたわら茶屋を営むことになった八雲だったが、開店早々、不良学生に目をつけられてしまう。そこへ颯爽と現れたのが、白馬の少女・徳河吉音（とくがわよしね）。彼女は豪快なチャンバラの末に不良共を追っ払うと、これも縁だと八雲の茶屋の用心棒を買って出る。吉音の無垢な正義感に付き合わされ、彼女の世直しの手伝いをする羽目になる八雲。次々と出会う百花繚乱な乙女たちとのドタバタの毎日。共闘し、時に敵対し、そしていつしか学園に渦巻く巨大な陰謀へと巻き込まれていく。