ついに復活を果たしたグレン。「グレン帝国」建国の野望を果たすべく、宇宙空間に逃げ出したところに、第二調査チームを乗せた宇宙船コーカスが到着する。地球圏への帰還を画策するグレンは、その宇宙船に潜入したところ、あのシズカ・グレーンの姿を見つけ、彼女に復讐を誓うのだった…。第二調査隊には、前シリーズで月面遺跡を破壊したシズカ・グレーン以外に、シズカに憧れる直情型の部下カティア・ウェンデル、調査隊のメンバーで超能力（遠隔知覚）を持つアリエル・コレットらがいるほか、エレン・マーベル、キリシマ・ミコも登場する。 カティアの思いこみで彼女に追いかけられるハメになるが、当初の目的通りシズカへの復讐は完遂するのだろうか。それとも…。