かつて日ノ本国は『帝』という君主を頂点に抱き、貴族が支配をする絶対帝政の国であった。その日ノ本である時、革命が起こる。そして革命が起こってから三年目の夏。『帝』をはじめとする貴族達の多くは、日ノ本国を追放され、日ノ本国は共和制の国となったのだった。日ノ本国が共和制となり十年以上の時が流れ、今、『菊ノ葉学園』で二人の女剣士が剣を交えていた。一人は日ノ本国を統治していた『帝』に連なるもので、菊ノ葉学園生徒会長の許嫁でもある、龍田宮アリア。もう一人は、アリアの存在の前に永遠の二番手と呼ばれている生徒会憲兵部の山野乃恵美だった。生徒から圧倒的な人気を受けるアリアと、冷酷で高慢な性格の為に全く人気のない乃恵美。この両者共に、日ノ本国を想う気持ちは強いものがある。だが、共和制の強硬派で民族主義者でもある乃恵美にとって、アリアは認められない存在。それはアリアの母が、隣国ロースシルトの皇帝の一族の為だった。アリアの存在はいつかは、日ノ本国の共和制を危うくする。そう信じ込んでいる乃恵美が、アリアとロースシルト国の間諜が深夜に対峙しているのを見た時から――この物語が動き出す。アリアの一途な正義と乃恵美の歪んだ正義。その二つの正義が絡み合いながら、日ノ本国を震撼させる冤罪事件が展開していくのだった。特集： LILITH特集