「女子陸上部のコーチをしてくれないか？」南瀬高（みなみせたか）は、その依頼に大きく頷いた。期待と希望に満ちた将来を打ち消す、あの一瞬の事故。そのまま卒業を迎えてしまった悔しさ。それでも諦めずにリハビリを続けてきた高にとって、この依頼は希望溢れるものだった。たとえ立場が変わっても、走ることに携われる喜び。今年度で廃校を迎える母校への想い。そして、新しい目標。持ち前の前向き思考と希望を胸に、高は新しい一歩を踏み出す。しかしその先には、様々な困難が待ち受けていた――
突然の幼馴染みとのキス。それは、今まで異性にとんと縁の無かった『恋愛に（純情過ぎる）空想を抱いている』主人公にとって、あまりに突然の出来事。しかも、共に両親が出かけてしまい、しばしの間、幼馴染みと2人きりで生活することに。「一体、どんな顔して生活すれば！」そんな戸惑いと、かなりのワクワクに満ちた生活が始まる、はずだった。それは何が『契機』になったのか、どこに『きっかけ』があったのか。突然「主人公の子を孕みに来たよ！」と元気な少女が飛び込んで来たり「代々伝わるお役目ですから……」とつっけんどんに理由を述べては女の子が子種を所望してきたり。更には学校の先生に扮した諜報員から「とりあえず、私と契って欲しいワケ」と力ずくで手篭めにされそうになったかと思えば「……うす。監視するから、一緒に生活する」と夢の中の少女が現実世界に現れてみたり――と、幼馴染と押し掛け女の子達との『男1人女5人』が一つ屋根の下、賑やかな同居生活が始まったのでした。……しかし、主人公は憮然とした面持ち。「いきなり肉体関係とか何とか……俺はドキドキと手を繋ぐところから始まる恋愛がしたいんだ〜！！」そんなピュアな主人公と、其々の思惑を胸に秘めた5人の少女達との『少し訳有り』な同居生活が、唐突に幕を開けたのでした。
キューピッド……古来より恋を運んでくれる存在。ずっとずっとずぅっと昔から、毎月どこかの町にキューピッドは降り立っていました。恋に不慣れな少年少女を助けるために、みんなに内緒で来ているのです。そして、今月。夕凪町という、どこにでもある平凡なこの町にも、一人のキューピッドが舞い降りる事になりました。可愛くて、優しくて、ちょっぴりドジなキューピッドが。ごく普通の大学生であった高山忍は、うだるような暑さの続く夏のある日、買い物帰りに怪しげなたまごを発見する。なぜかたまごに懐かれてしまった（？）忍は、不思議に思いつつもたまごを自宅に持ち帰る事に。翌日目が覚めてみると、自分の体が小さくなってしまっているのに気付き狼狽する忍。そこに、たまごの持ち主を名乗るキューピッドのメルが現れる。メルから事情をきくところによると、どうやらたまごから「ぱこ」と呼ばれる天界の生物が孵るときに、忍のエナジーが吸い取られてしまい、小さくなってしまったらしい。元に戻る為には、メルの修行――すなわちカップルの作成――を成功させなければいけないと判った忍は、妹であるみことの提案を受け入れ、みことの通う学園に転入する事に。不慣れな体に新しい学園生活。はたして、忍は無事にメルの修行を成功させ、元の体に戻る事はできるのだろうか？それとも……
「本日より湖城学園生徒会役員は全員、下着一切の着用を禁止します！」それは余りにも青天の霹靂。鉄壁美少女、学園のカリスマたる学園執行部会長・伊佐木千渟の発したこの命令が、執行部役員たちの日常を一変させてしまいます。こうなった原因は、主人公・生徒会庶務係の柊誠悟との売り言葉に買い言葉。「横暴だ！」と抗議しながらも、心の底ではもしかして、おいしいかも、と考える誠悟。当然他役員の非難を浴びる破目に。「原因はあんたなんだから！なんとかしなさいよ！！」役員女子からの圧力を受け、問題解決のために全力を尽くすことを宣誓させられる誠悟でしたが、彼には千渟の意見を翻させるなんて自信は全くないのでした……。こうして、相反する千渟と執行部女子たちの間で、誠悟は否応なく駆けずり回ることになります。
温暖で穏やかな土地にある学園都市。天龍市。両親の単身赴任でこの土地を離れていた主人公は、入学の為に、一人この街に戻ってきた。昔住んでいた街とは言え、前とは一段階上の学園生活に、胸をふくらませる。そんな新鮮な日々の中、ある日海岸を見下ろせる高台にやってきた主人公。海が見渡せる、寂れてはいるが穏やかな場所で、透き通った声で歌う一人の少女と出会う。新しい環境での様々な出会いの結晶が、優しく音色を奏で始めた――新しい環境、新しい生活が始まる主人公と、それを取り巻く個性的なヒロインを中心にして、この街や学園で繰り広げられる、様々な楽しい出来事を通じて、ヒロイン達と心を通わせていく、学園物アドベンチャーをベースに置きながらも既成作品とは一線を画す、青春物語となります。
